Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20828J3KMI7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20828J3KMI7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20828J3KMI7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20828J3KMI7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20828J3KMI7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm20828J3KMI7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm20828J3KMI7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm20828J3KMI7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm20828J3KMI7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm20828J3KMI7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm20828J3KMI7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm20828J3KMI7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm20828J3KMI7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm20828J3KMI7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm20828J3KMI7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm20828J3KMI7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm20828J3KMI7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20828J3KMI7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20828J3KMI7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20828J3KMI7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20828J3KMI7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20828J3KMI7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20828J3KMI7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20828J3KMI7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20828J3KMI7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20828J3KMI7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20828J3KMI7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20828J3KMI7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20828J3KMI7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20828J3KMI7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm20828J3KMI7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm20828J3KMI7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm20828J3KMI7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm20828J3KMI7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm20828J3KMI7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm20828J3KMI7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm20828J3KMI7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm20828J3KMI7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm20828J3KMI7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm20828J3KMI7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm20828J3KMI7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm20828J3KMI7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm20828J3KMI7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm20828J3KMI7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm20828J3KMI7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm20828J3KMI7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm20828J3KMI7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm20828J3KMI7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm20828J3KMI7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm20828J3KMI7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm20828J3KMI7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm20828J3KMI7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm20828J3KMI7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm20828J3KMI7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm20828J3KMI7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm20828J3KMI7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm20828J3KMI7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm20828J3KMI7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm20828J3KMI7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Gm20828J3KMI7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm20828J3KMI7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm20828J3KMI7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm20828J3KMI7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm20828J3KMI7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm20828J3KMI7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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Gm20828J3KMI7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm20828J3KMI7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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