Protein–RNA interactions for Protein: F5H4B4

FAM227A, Protein FAM227A, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227AF5H4B4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM227AF5H4B4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM227AF5H4B4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.33■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM227AF5H4B4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms