Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3E1

Aldh3b2, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B2, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b2E9Q3E1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Aldh3b2E9Q3E1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Aldh3b2E9Q3E1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Aldh3b2E9Q3E1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Aldh3b2E9Q3E1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Aldh3b2E9Q3E1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Aldh3b2E9Q3E1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Aldh3b2E9Q3E1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Aldh3b2E9Q3E1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Aldh3b2E9Q3E1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Aldh3b2E9Q3E1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Aldh3b2E9Q3E1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Aldh3b2E9Q3E1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Aldh3b2E9Q3E1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Aldh3b2E9Q3E1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Aldh3b2E9Q3E1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Aldh3b2E9Q3E1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Aldh3b2E9Q3E1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Aldh3b2E9Q3E1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Aldh3b2E9Q3E1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Aldh3b2E9Q3E1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Aldh3b2E9Q3E1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Aldh3b2E9Q3E1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Aldh3b2E9Q3E1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Aldh3b2E9Q3E1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms