Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc144bE9PVZ3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc144bE9PVZ3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc144bE9PVZ3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc144bE9PVZ3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc144bE9PVZ3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc144bE9PVZ3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc144bE9PVZ3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc144bE9PVZ3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc144bE9PVZ3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc144bE9PVZ3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc144bE9PVZ3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc144bE9PVZ3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc144bE9PVZ3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc144bE9PVZ3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc144bE9PVZ3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc144bE9PVZ3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc144bE9PVZ3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc144bE9PVZ3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc144bE9PVZ3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc144bE9PVZ3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc144bE9PVZ3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc144bE9PVZ3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc144bE9PVZ3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc144bE9PVZ3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc144bE9PVZ3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc144bE9PVZ3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc144bE9PVZ3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc144bE9PVZ3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc144bE9PVZ3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc144bE9PVZ3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc144bE9PVZ3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc144bE9PVZ3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc144bE9PVZ3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc144bE9PVZ3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc144bE9PVZ3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc144bE9PVZ3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc144bE9PVZ3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc144bE9PVZ3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc144bE9PVZ3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc144bE9PVZ3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc144bE9PVZ3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc144bE9PVZ3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc144bE9PVZ3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc144bE9PVZ3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc144bE9PVZ3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc144bE9PVZ3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc144bE9PVZ3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc144bE9PVZ3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc144bE9PVZ3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc144bE9PVZ3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc144bE9PVZ3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc144bE9PVZ3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc144bE9PVZ3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc144bE9PVZ3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc144bE9PVZ3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc144bE9PVZ3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc144bE9PVZ3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc144bE9PVZ3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc144bE9PVZ3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc144bE9PVZ3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc144bE9PVZ3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc144bE9PVZ3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc144bE9PVZ3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc144bE9PVZ3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc144bE9PVZ3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc144bE9PVZ3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc144bE9PVZ3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc144bE9PVZ3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc144bE9PVZ3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc144bE9PVZ3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc144bE9PVZ3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc144bE9PVZ3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc144bE9PVZ3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc144bE9PVZ3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc144bE9PVZ3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc144bE9PVZ3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc144bE9PVZ3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc144bE9PVZ3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc144bE9PVZ3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc144bE9PVZ3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc144bE9PVZ3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc144bE9PVZ3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc144bE9PVZ3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc144bE9PVZ3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc144bE9PVZ3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc144bE9PVZ3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc144bE9PVZ3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc144bE9PVZ3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc144bE9PVZ3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc144bE9PVZ3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc144bE9PVZ3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc144bE9PVZ3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc144bE9PVZ3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 191.6 ms