Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprbB2RU80 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
PtprbB2RU80 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PtprbB2RU80 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
PtprbB2RU80 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprbB2RU80 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprbB2RU80 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprbB2RU80 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprbB2RU80 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprbB2RU80 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprbB2RU80 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprbB2RU80 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprbB2RU80 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprbB2RU80 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprbB2RU80 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprbB2RU80 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprbB2RU80 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprbB2RU80 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprbB2RU80 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprbB2RU80 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprbB2RU80 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprbB2RU80 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprbB2RU80 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprbB2RU80 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprbB2RU80 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprbB2RU80 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprbB2RU80 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprbB2RU80 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprbB2RU80 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprbB2RU80 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprbB2RU80 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprbB2RU80 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprbB2RU80 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprbB2RU80 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprbB2RU80 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprbB2RU80 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprbB2RU80 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprbB2RU80 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprbB2RU80 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprbB2RU80 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprbB2RU80 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprbB2RU80 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprbB2RU80 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprbB2RU80 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprbB2RU80 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprbB2RU80 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprbB2RU80 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PtprbB2RU80 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PtprbB2RU80 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PtprbB2RU80 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PtprbB2RU80 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PtprbB2RU80 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms