Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM3

RIMBP3B, RIMS-binding protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP3BA6NNM3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
RIMBP3BA6NNM3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
RIMBP3BA6NNM3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
RIMBP3BA6NNM3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
RIMBP3BA6NNM3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
RIMBP3BA6NNM3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
RIMBP3BA6NNM3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
RIMBP3BA6NNM3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
RIMBP3BA6NNM3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
RIMBP3BA6NNM3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
RIMBP3BA6NNM3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC36.71■■■■□ 3.47
RIMBP3BA6NNM3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
RIMBP3BA6NNM3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
RIMBP3BA6NNM3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
RIMBP3BA6NNM3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
RIMBP3BA6NNM3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
RIMBP3BA6NNM3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
RIMBP3BA6NNM3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
RIMBP3BA6NNM3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC36.7■■■■□ 3.47
RIMBP3BA6NNM3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
RIMBP3BA6NNM3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
RIMBP3BA6NNM3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
RIMBP3BA6NNM3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
RIMBP3BA6NNM3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
RIMBP3BA6NNM3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
RIMBP3BA6NNM3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
RIMBP3BA6NNM3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
RIMBP3BA6NNM3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
RIMBP3BA6NNM3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
RIMBP3BA6NNM3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
RIMBP3BA6NNM3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
RIMBP3BA6NNM3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
RIMBP3BA6NNM3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
RIMBP3BA6NNM3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
RIMBP3BA6NNM3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
RIMBP3BA6NNM3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
RIMBP3BA6NNM3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
RIMBP3BA6NNM3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
RIMBP3BA6NNM3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
RIMBP3BA6NNM3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
RIMBP3BA6NNM3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
RIMBP3BA6NNM3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
RIMBP3BA6NNM3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
RIMBP3BA6NNM3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
RIMBP3BA6NNM3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
RIMBP3BA6NNM3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
RIMBP3BA6NNM3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
RIMBP3BA6NNM3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
RIMBP3BA6NNM3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
RIMBP3BA6NNM3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
RIMBP3BA6NNM3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
RIMBP3BA6NNM3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
RIMBP3BA6NNM3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
RIMBP3BA6NNM3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
RIMBP3BA6NNM3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
RIMBP3BA6NNM3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
RIMBP3BA6NNM3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
RIMBP3BA6NNM3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
RIMBP3BA6NNM3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
RIMBP3BA6NNM3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
RIMBP3BA6NNM3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
RIMBP3BA6NNM3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
RIMBP3BA6NNM3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
RIMBP3BA6NNM3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
RIMBP3BA6NNM3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
RIMBP3BA6NNM3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
RIMBP3BA6NNM3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
RIMBP3BA6NNM3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
RIMBP3BA6NNM3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
RIMBP3BA6NNM3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
RIMBP3BA6NNM3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
RIMBP3BA6NNM3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
RIMBP3BA6NNM3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
RIMBP3BA6NNM3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
RIMBP3BA6NNM3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
RIMBP3BA6NNM3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
RIMBP3BA6NNM3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
RIMBP3BA6NNM3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
RIMBP3BA6NNM3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
RIMBP3BA6NNM3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
RIMBP3BA6NNM3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
RIMBP3BA6NNM3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
RIMBP3BA6NNM3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
RIMBP3BA6NNM3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
RIMBP3BA6NNM3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
RIMBP3BA6NNM3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
RIMBP3BA6NNM3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
RIMBP3BA6NNM3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
RIMBP3BA6NNM3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
RIMBP3BA6NNM3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
RIMBP3BA6NNM3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
RIMBP3BA6NNM3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.44
RIMBP3BA6NNM3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.44
RIMBP3BA6NNM3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
RIMBP3BA6NNM3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
RIMBP3BA6NNM3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
RIMBP3BA6NNM3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
RIMBP3BA6NNM3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
RIMBP3BA6NNM3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
RIMBP3BA6NNM3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms