Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdc27A2A6Q5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdc27A2A6Q5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdc27A2A6Q5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdc27A2A6Q5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdc27A2A6Q5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdc27A2A6Q5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdc27A2A6Q5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdc27A2A6Q5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdc27A2A6Q5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdc27A2A6Q5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdc27A2A6Q5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdc27A2A6Q5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdc27A2A6Q5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdc27A2A6Q5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdc27A2A6Q5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdc27A2A6Q5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cdc27A2A6Q5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdc27A2A6Q5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdc27A2A6Q5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdc27A2A6Q5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdc27A2A6Q5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdc27A2A6Q5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdc27A2A6Q5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdc27A2A6Q5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdc27A2A6Q5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdc27A2A6Q5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdc27A2A6Q5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdc27A2A6Q5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdc27A2A6Q5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdc27A2A6Q5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdc27A2A6Q5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdc27A2A6Q5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdc27A2A6Q5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdc27A2A6Q5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdc27A2A6Q5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdc27A2A6Q5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdc27A2A6Q5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdc27A2A6Q5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdc27A2A6Q5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdc27A2A6Q5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdc27A2A6Q5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdc27A2A6Q5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdc27A2A6Q5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdc27A2A6Q5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdc27A2A6Q5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdc27A2A6Q5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdc27A2A6Q5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdc27A2A6Q5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdc27A2A6Q5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdc27A2A6Q5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdc27A2A6Q5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdc27A2A6Q5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdc27A2A6Q5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdc27A2A6Q5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdc27A2A6Q5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdc27A2A6Q5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdc27A2A6Q5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdc27A2A6Q5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdc27A2A6Q5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdc27A2A6Q5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdc27A2A6Q5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdc27A2A6Q5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdc27A2A6Q5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdc27A2A6Q5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdc27A2A6Q5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdc27A2A6Q5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdc27A2A6Q5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdc27A2A6Q5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdc27A2A6Q5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdc27A2A6Q5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdc27A2A6Q5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdc27A2A6Q5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdc27A2A6Q5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdc27A2A6Q5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdc27A2A6Q5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdc27A2A6Q5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdc27A2A6Q5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdc27A2A6Q5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdc27A2A6Q5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdc27A2A6Q5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdc27A2A6Q5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdc27A2A6Q5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdc27A2A6Q5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdc27A2A6Q5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdc27A2A6Q5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdc27A2A6Q5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdc27A2A6Q5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdc27A2A6Q5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdc27A2A6Q5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdc27A2A6Q5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdc27A2A6Q5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdc27A2A6Q5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdc27A2A6Q5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdc27A2A6Q5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdc27A2A6Q5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdc27A2A6Q5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdc27A2A6Q5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdc27A2A6Q5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdc27A2A6Q5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms