Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RPT6

4930433I11Rik, RIKEN cDNA 4930433I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.5 ms