Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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Trbv30A0A0B4J1P1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Trbv30A0A0B4J1P1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Trbv30A0A0B4J1P1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Trbv30A0A0B4J1P1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Trbv30A0A0B4J1P1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv30A0A0B4J1P1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Trbv30A0A0B4J1P1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Trbv30A0A0B4J1P1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Trbv30A0A0B4J1P1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv30A0A0B4J1P1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Trbv30A0A0B4J1P1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv30A0A0B4J1P1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv30A0A0B4J1P1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv30A0A0B4J1P1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Trbv30A0A0B4J1P1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Trbv30A0A0B4J1P1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv30A0A0B4J1P1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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