Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubl3Q9Z2M6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubl3Q9Z2M6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubl3Q9Z2M6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubl3Q9Z2M6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubl3Q9Z2M6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubl3Q9Z2M6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubl3Q9Z2M6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubl3Q9Z2M6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubl3Q9Z2M6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ubl3Q9Z2M6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubl3Q9Z2M6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubl3Q9Z2M6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubl3Q9Z2M6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubl3Q9Z2M6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubl3Q9Z2M6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubl3Q9Z2M6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubl3Q9Z2M6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubl3Q9Z2M6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubl3Q9Z2M6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubl3Q9Z2M6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ubl3Q9Z2M6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ubl3Q9Z2M6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ubl3Q9Z2M6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ubl3Q9Z2M6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ubl3Q9Z2M6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ubl3Q9Z2M6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ubl3Q9Z2M6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ubl3Q9Z2M6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ubl3Q9Z2M6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubl3Q9Z2M6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubl3Q9Z2M6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubl3Q9Z2M6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubl3Q9Z2M6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubl3Q9Z2M6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubl3Q9Z2M6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubl3Q9Z2M6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubl3Q9Z2M6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubl3Q9Z2M6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubl3Q9Z2M6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubl3Q9Z2M6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubl3Q9Z2M6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ubl3Q9Z2M6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ubl3Q9Z2M6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms