Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLXND1Q9Y4D7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PLXND1Q9Y4D7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms