Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV18

Gabbr1, Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabbr1Q9WV18 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gabbr1Q9WV18 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gabbr1Q9WV18 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gabbr1Q9WV18 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gabbr1Q9WV18 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gabbr1Q9WV18 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gabbr1Q9WV18 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gabbr1Q9WV18 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gabbr1Q9WV18 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gabbr1Q9WV18 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gabbr1Q9WV18 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gabbr1Q9WV18 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gabbr1Q9WV18 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gabbr1Q9WV18 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gabbr1Q9WV18 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gabbr1Q9WV18 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gabbr1Q9WV18 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gabbr1Q9WV18 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gabbr1Q9WV18 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gabbr1Q9WV18 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gabbr1Q9WV18 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gabbr1Q9WV18 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gabbr1Q9WV18 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gabbr1Q9WV18 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gabbr1Q9WV18 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gabbr1Q9WV18 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gabbr1Q9WV18 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gabbr1Q9WV18 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gabbr1Q9WV18 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gabbr1Q9WV18 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gabbr1Q9WV18 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gabbr1Q9WV18 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gabbr1Q9WV18 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gabbr1Q9WV18 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gabbr1Q9WV18 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gabbr1Q9WV18 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gabbr1Q9WV18 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gabbr1Q9WV18 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gabbr1Q9WV18 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gabbr1Q9WV18 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gabbr1Q9WV18 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gabbr1Q9WV18 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gabbr1Q9WV18 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gabbr1Q9WV18 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gabbr1Q9WV18 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gabbr1Q9WV18 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gabbr1Q9WV18 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gabbr1Q9WV18 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gabbr1Q9WV18 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gabbr1Q9WV18 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gabbr1Q9WV18 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gabbr1Q9WV18 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gabbr1Q9WV18 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gabbr1Q9WV18 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gabbr1Q9WV18 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gabbr1Q9WV18 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gabbr1Q9WV18 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gabbr1Q9WV18 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gabbr1Q9WV18 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gabbr1Q9WV18 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gabbr1Q9WV18 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gabbr1Q9WV18 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gabbr1Q9WV18 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gabbr1Q9WV18 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gabbr1Q9WV18 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gabbr1Q9WV18 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gabbr1Q9WV18 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gabbr1Q9WV18 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gabbr1Q9WV18 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gabbr1Q9WV18 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gabbr1Q9WV18 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gabbr1Q9WV18 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gabbr1Q9WV18 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gabbr1Q9WV18 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gabbr1Q9WV18 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gabbr1Q9WV18 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gabbr1Q9WV18 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gabbr1Q9WV18 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gabbr1Q9WV18 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gabbr1Q9WV18 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gabbr1Q9WV18 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gabbr1Q9WV18 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gabbr1Q9WV18 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gabbr1Q9WV18 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gabbr1Q9WV18 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gabbr1Q9WV18 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gabbr1Q9WV18 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gabbr1Q9WV18 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gabbr1Q9WV18 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gabbr1Q9WV18 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gabbr1Q9WV18 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Gabbr1Q9WV18 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gabbr1Q9WV18 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gabbr1Q9WV18 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gabbr1Q9WV18 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gabbr1Q9WV18 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gabbr1Q9WV18 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gabbr1Q9WV18 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gabbr1Q9WV18 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gabbr1Q9WV18 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms