Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUF1

Vmn1r49, Vomeronasal type-1 receptor 49, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r49Q9WUF1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r49Q9WUF1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r49Q9WUF1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r49Q9WUF1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r49Q9WUF1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r49Q9WUF1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r49Q9WUF1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r49Q9WUF1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r49Q9WUF1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r49Q9WUF1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r49Q9WUF1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r49Q9WUF1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r49Q9WUF1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r49Q9WUF1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r49Q9WUF1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r49Q9WUF1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r49Q9WUF1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r49Q9WUF1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r49Q9WUF1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r49Q9WUF1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r49Q9WUF1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r49Q9WUF1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r49Q9WUF1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r49Q9WUF1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r49Q9WUF1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r49Q9WUF1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r49Q9WUF1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r49Q9WUF1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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Vmn1r49Q9WUF1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r49Q9WUF1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r49Q9WUF1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r49Q9WUF1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r49Q9WUF1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r49Q9WUF1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r49Q9WUF1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r49Q9WUF1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r49Q9WUF1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r49Q9WUF1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r49Q9WUF1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r49Q9WUF1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r49Q9WUF1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
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Vmn1r49Q9WUF1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r49Q9WUF1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r49Q9WUF1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r49Q9WUF1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r49Q9WUF1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r49Q9WUF1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Vmn1r49Q9WUF1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Vmn1r49Q9WUF1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Vmn1r49Q9WUF1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r49Q9WUF1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r49Q9WUF1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r49Q9WUF1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r49Q9WUF1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r49Q9WUF1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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Vmn1r49Q9WUF1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r49Q9WUF1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r49Q9WUF1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r49Q9WUF1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r49Q9WUF1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
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Vmn1r49Q9WUF1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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Vmn1r49Q9WUF1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r49Q9WUF1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r49Q9WUF1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r49Q9WUF1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r49Q9WUF1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r49Q9WUF1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r49Q9WUF1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r49Q9WUF1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r49Q9WUF1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r49Q9WUF1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r49Q9WUF1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r49Q9WUF1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r49Q9WUF1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r49Q9WUF1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r49Q9WUF1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r49Q9WUF1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r49Q9WUF1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r49Q9WUF1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r49Q9WUF1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r49Q9WUF1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r49Q9WUF1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r49Q9WUF1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r49Q9WUF1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r49Q9WUF1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r49Q9WUF1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r49Q9WUF1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r49Q9WUF1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r49Q9WUF1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r49Q9WUF1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r49Q9WUF1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r49Q9WUF1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r49Q9WUF1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r49Q9WUF1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r49Q9WUF1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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