Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SAMD4AQ9UPU9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
SAMD4AQ9UPU9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SAMD4AQ9UPU9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SAMD4AQ9UPU9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SAMD4AQ9UPU9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SAMD4AQ9UPU9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SAMD4AQ9UPU9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SAMD4AQ9UPU9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SAMD4AQ9UPU9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SAMD4AQ9UPU9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SAMD4AQ9UPU9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SAMD4AQ9UPU9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SAMD4AQ9UPU9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SAMD4AQ9UPU9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SAMD4AQ9UPU9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SAMD4AQ9UPU9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SAMD4AQ9UPU9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SAMD4AQ9UPU9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SAMD4AQ9UPU9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SAMD4AQ9UPU9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SAMD4AQ9UPU9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SAMD4AQ9UPU9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SAMD4AQ9UPU9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SAMD4AQ9UPU9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SAMD4AQ9UPU9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SAMD4AQ9UPU9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SAMD4AQ9UPU9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SAMD4AQ9UPU9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SAMD4AQ9UPU9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SAMD4AQ9UPU9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SAMD4AQ9UPU9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SAMD4AQ9UPU9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SAMD4AQ9UPU9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SAMD4AQ9UPU9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SAMD4AQ9UPU9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SAMD4AQ9UPU9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SAMD4AQ9UPU9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SAMD4AQ9UPU9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SAMD4AQ9UPU9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SAMD4AQ9UPU9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SAMD4AQ9UPU9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SAMD4AQ9UPU9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SAMD4AQ9UPU9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SAMD4AQ9UPU9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SAMD4AQ9UPU9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SAMD4AQ9UPU9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SAMD4AQ9UPU9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SAMD4AQ9UPU9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SAMD4AQ9UPU9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SAMD4AQ9UPU9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SAMD4AQ9UPU9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SAMD4AQ9UPU9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms