Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CYTH4Q9UIA0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CYTH4Q9UIA0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CYTH4Q9UIA0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CYTH4Q9UIA0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CYTH4Q9UIA0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYTH4Q9UIA0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYTH4Q9UIA0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYTH4Q9UIA0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYTH4Q9UIA0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYTH4Q9UIA0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYTH4Q9UIA0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYTH4Q9UIA0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYTH4Q9UIA0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYTH4Q9UIA0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYTH4Q9UIA0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYTH4Q9UIA0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYTH4Q9UIA0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYTH4Q9UIA0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYTH4Q9UIA0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYTH4Q9UIA0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYTH4Q9UIA0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYTH4Q9UIA0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYTH4Q9UIA0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYTH4Q9UIA0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYTH4Q9UIA0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYTH4Q9UIA0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYTH4Q9UIA0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYTH4Q9UIA0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYTH4Q9UIA0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYTH4Q9UIA0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYTH4Q9UIA0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYTH4Q9UIA0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYTH4Q9UIA0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYTH4Q9UIA0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYTH4Q9UIA0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYTH4Q9UIA0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYTH4Q9UIA0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYTH4Q9UIA0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYTH4Q9UIA0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYTH4Q9UIA0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYTH4Q9UIA0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYTH4Q9UIA0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYTH4Q9UIA0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYTH4Q9UIA0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYTH4Q9UIA0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYTH4Q9UIA0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYTH4Q9UIA0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYTH4Q9UIA0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CYTH4Q9UIA0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CYTH4Q9UIA0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CYTH4Q9UIA0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CYTH4Q9UIA0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CYTH4Q9UIA0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CYTH4Q9UIA0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CYTH4Q9UIA0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CYTH4Q9UIA0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CYTH4Q9UIA0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CYTH4Q9UIA0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CYTH4Q9UIA0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CYTH4Q9UIA0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CYTH4Q9UIA0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CYTH4Q9UIA0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYTH4Q9UIA0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CYTH4Q9UIA0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYTH4Q9UIA0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYTH4Q9UIA0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYTH4Q9UIA0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYTH4Q9UIA0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYTH4Q9UIA0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYTH4Q9UIA0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYTH4Q9UIA0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYTH4Q9UIA0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYTH4Q9UIA0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYTH4Q9UIA0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CYTH4Q9UIA0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYTH4Q9UIA0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CYTH4Q9UIA0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYTH4Q9UIA0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYTH4Q9UIA0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYTH4Q9UIA0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYTH4Q9UIA0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYTH4Q9UIA0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYTH4Q9UIA0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CYTH4Q9UIA0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CYTH4Q9UIA0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CYTH4Q9UIA0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CYTH4Q9UIA0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CYTH4Q9UIA0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CYTH4Q9UIA0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.7 ms