Protein–RNA interactions for Protein: Q9R000

Itgb1bp2, Integrin beta-1-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1bp2Q9R000 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itgb1bp2Q9R000 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Itgb1bp2Q9R000 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Itgb1bp2Q9R000 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Itgb1bp2Q9R000 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Itgb1bp2Q9R000 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Itgb1bp2Q9R000 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itgb1bp2Q9R000 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itgb1bp2Q9R000 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itgb1bp2Q9R000 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Itgb1bp2Q9R000 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itgb1bp2Q9R000 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itgb1bp2Q9R000 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itgb1bp2Q9R000 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itgb1bp2Q9R000 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itgb1bp2Q9R000 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itgb1bp2Q9R000 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itgb1bp2Q9R000 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itgb1bp2Q9R000 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itgb1bp2Q9R000 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itgb1bp2Q9R000 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itgb1bp2Q9R000 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itgb1bp2Q9R000 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itgb1bp2Q9R000 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itgb1bp2Q9R000 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itgb1bp2Q9R000 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itgb1bp2Q9R000 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itgb1bp2Q9R000 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itgb1bp2Q9R000 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb1bp2Q9R000 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb1bp2Q9R000 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb1bp2Q9R000 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb1bp2Q9R000 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb1bp2Q9R000 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb1bp2Q9R000 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itgb1bp2Q9R000 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itgb1bp2Q9R000 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itgb1bp2Q9R000 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itgb1bp2Q9R000 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Itgb1bp2Q9R000 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Itgb1bp2Q9R000 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itgb1bp2Q9R000 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itgb1bp2Q9R000 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itgb1bp2Q9R000 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itgb1bp2Q9R000 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itgb1bp2Q9R000 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itgb1bp2Q9R000 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itgb1bp2Q9R000 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itgb1bp2Q9R000 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Itgb1bp2Q9R000 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Itgb1bp2Q9R000 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Itgb1bp2Q9R000 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Itgb1bp2Q9R000 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Itgb1bp2Q9R000 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itgb1bp2Q9R000 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itgb1bp2Q9R000 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itgb1bp2Q9R000 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Itgb1bp2Q9R000 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itgb1bp2Q9R000 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itgb1bp2Q9R000 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itgb1bp2Q9R000 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Itgb1bp2Q9R000 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb1bp2Q9R000 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb1bp2Q9R000 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb1bp2Q9R000 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb1bp2Q9R000 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb1bp2Q9R000 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb1bp2Q9R000 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb1bp2Q9R000 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Itgb1bp2Q9R000 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb1bp2Q9R000 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb1bp2Q9R000 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb1bp2Q9R000 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb1bp2Q9R000 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Itgb1bp2Q9R000 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb1bp2Q9R000 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb1bp2Q9R000 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb1bp2Q9R000 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb1bp2Q9R000 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Itgb1bp2Q9R000 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb1bp2Q9R000 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb1bp2Q9R000 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb1bp2Q9R000 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb1bp2Q9R000 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb1bp2Q9R000 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb1bp2Q9R000 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb1bp2Q9R000 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb1bp2Q9R000 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb1bp2Q9R000 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb1bp2Q9R000 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb1bp2Q9R000 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb1bp2Q9R000 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb1bp2Q9R000 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb1bp2Q9R000 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Itgb1bp2Q9R000 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itgb1bp2Q9R000 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itgb1bp2Q9R000 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itgb1bp2Q9R000 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itgb1bp2Q9R000 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itgb1bp2Q9R000 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms