Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VapbQ9QY76 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VapbQ9QY76 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VapbQ9QY76 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VapbQ9QY76 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VapbQ9QY76 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VapbQ9QY76 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VapbQ9QY76 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VapbQ9QY76 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VapbQ9QY76 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VapbQ9QY76 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VapbQ9QY76 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VapbQ9QY76 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VapbQ9QY76 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VapbQ9QY76 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VapbQ9QY76 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VapbQ9QY76 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VapbQ9QY76 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VapbQ9QY76 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VapbQ9QY76 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VapbQ9QY76 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VapbQ9QY76 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
VapbQ9QY76 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VapbQ9QY76 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VapbQ9QY76 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VapbQ9QY76 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VapbQ9QY76 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VapbQ9QY76 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VapbQ9QY76 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
VapbQ9QY76 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VapbQ9QY76 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VapbQ9QY76 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VapbQ9QY76 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VapbQ9QY76 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VapbQ9QY76 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms