Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lsm4Q9QXA5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm4Q9QXA5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms