Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZDHHC3Q9NYG2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
ZDHHC3Q9NYG2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZDHHC3Q9NYG2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZDHHC3Q9NYG2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZDHHC3Q9NYG2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZDHHC3Q9NYG2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZDHHC3Q9NYG2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZDHHC3Q9NYG2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZDHHC3Q9NYG2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZDHHC3Q9NYG2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZDHHC3Q9NYG2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZDHHC3Q9NYG2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZDHHC3Q9NYG2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZDHHC3Q9NYG2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZDHHC3Q9NYG2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZDHHC3Q9NYG2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZDHHC3Q9NYG2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZDHHC3Q9NYG2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZDHHC3Q9NYG2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZDHHC3Q9NYG2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZDHHC3Q9NYG2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZDHHC3Q9NYG2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZDHHC3Q9NYG2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZDHHC3Q9NYG2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZDHHC3Q9NYG2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZDHHC3Q9NYG2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZDHHC3Q9NYG2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZDHHC3Q9NYG2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZDHHC3Q9NYG2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZDHHC3Q9NYG2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZDHHC3Q9NYG2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZDHHC3Q9NYG2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZDHHC3Q9NYG2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZDHHC3Q9NYG2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZDHHC3Q9NYG2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZDHHC3Q9NYG2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZDHHC3Q9NYG2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZDHHC3Q9NYG2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZDHHC3Q9NYG2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZDHHC3Q9NYG2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZDHHC3Q9NYG2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZDHHC3Q9NYG2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZDHHC3Q9NYG2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZDHHC3Q9NYG2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZDHHC3Q9NYG2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZDHHC3Q9NYG2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZDHHC3Q9NYG2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZDHHC3Q9NYG2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZDHHC3Q9NYG2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZDHHC3Q9NYG2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZDHHC3Q9NYG2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZDHHC3Q9NYG2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZDHHC3Q9NYG2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZDHHC3Q9NYG2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZDHHC3Q9NYG2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZDHHC3Q9NYG2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZDHHC3Q9NYG2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZDHHC3Q9NYG2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZDHHC3Q9NYG2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZDHHC3Q9NYG2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZDHHC3Q9NYG2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZDHHC3Q9NYG2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZDHHC3Q9NYG2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZDHHC3Q9NYG2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms