Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKU8

Lmx1a, LIM homeobox transcription factor 1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1aQ9JKU8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmx1aQ9JKU8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmx1aQ9JKU8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmx1aQ9JKU8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmx1aQ9JKU8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmx1aQ9JKU8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmx1aQ9JKU8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmx1aQ9JKU8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmx1aQ9JKU8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmx1aQ9JKU8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmx1aQ9JKU8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmx1aQ9JKU8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmx1aQ9JKU8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmx1aQ9JKU8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmx1aQ9JKU8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmx1aQ9JKU8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmx1aQ9JKU8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmx1aQ9JKU8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmx1aQ9JKU8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmx1aQ9JKU8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmx1aQ9JKU8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmx1aQ9JKU8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmx1aQ9JKU8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmx1aQ9JKU8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmx1aQ9JKU8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmx1aQ9JKU8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmx1aQ9JKU8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmx1aQ9JKU8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmx1aQ9JKU8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmx1aQ9JKU8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmx1aQ9JKU8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmx1aQ9JKU8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmx1aQ9JKU8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmx1aQ9JKU8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmx1aQ9JKU8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmx1aQ9JKU8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmx1aQ9JKU8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmx1aQ9JKU8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmx1aQ9JKU8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmx1aQ9JKU8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmx1aQ9JKU8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lmx1aQ9JKU8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lmx1aQ9JKU8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmx1aQ9JKU8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmx1aQ9JKU8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmx1aQ9JKU8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmx1aQ9JKU8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmx1aQ9JKU8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmx1aQ9JKU8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmx1aQ9JKU8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmx1aQ9JKU8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmx1aQ9JKU8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmx1aQ9JKU8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmx1aQ9JKU8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmx1aQ9JKU8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmx1aQ9JKU8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmx1aQ9JKU8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmx1aQ9JKU8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmx1aQ9JKU8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmx1aQ9JKU8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmx1aQ9JKU8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmx1aQ9JKU8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmx1aQ9JKU8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmx1aQ9JKU8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmx1aQ9JKU8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmx1aQ9JKU8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmx1aQ9JKU8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmx1aQ9JKU8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmx1aQ9JKU8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmx1aQ9JKU8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmx1aQ9JKU8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmx1aQ9JKU8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmx1aQ9JKU8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmx1aQ9JKU8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmx1aQ9JKU8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmx1aQ9JKU8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmx1aQ9JKU8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmx1aQ9JKU8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmx1aQ9JKU8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmx1aQ9JKU8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmx1aQ9JKU8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmx1aQ9JKU8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmx1aQ9JKU8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmx1aQ9JKU8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmx1aQ9JKU8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmx1aQ9JKU8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmx1aQ9JKU8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmx1aQ9JKU8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmx1aQ9JKU8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmx1aQ9JKU8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmx1aQ9JKU8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmx1aQ9JKU8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmx1aQ9JKU8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmx1aQ9JKU8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmx1aQ9JKU8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmx1aQ9JKU8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmx1aQ9JKU8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmx1aQ9JKU8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmx1aQ9JKU8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmx1aQ9JKU8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms