Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bgrlQ9JJU8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sh3bgrlQ9JJU8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms