Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bco1Q9JJS6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bco1Q9JJS6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bco1Q9JJS6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bco1Q9JJS6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bco1Q9JJS6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bco1Q9JJS6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bco1Q9JJS6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bco1Q9JJS6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bco1Q9JJS6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bco1Q9JJS6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bco1Q9JJS6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bco1Q9JJS6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bco1Q9JJS6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bco1Q9JJS6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bco1Q9JJS6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bco1Q9JJS6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bco1Q9JJS6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bco1Q9JJS6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bco1Q9JJS6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bco1Q9JJS6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Bco1Q9JJS6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bco1Q9JJS6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bco1Q9JJS6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bco1Q9JJS6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bco1Q9JJS6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bco1Q9JJS6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bco1Q9JJS6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bco1Q9JJS6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bco1Q9JJS6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bco1Q9JJS6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bco1Q9JJS6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bco1Q9JJS6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bco1Q9JJS6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bco1Q9JJS6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bco1Q9JJS6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bco1Q9JJS6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bco1Q9JJS6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bco1Q9JJS6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bco1Q9JJS6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bco1Q9JJS6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bco1Q9JJS6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bco1Q9JJS6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bco1Q9JJS6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bco1Q9JJS6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bco1Q9JJS6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bco1Q9JJS6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bco1Q9JJS6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Bco1Q9JJS6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bco1Q9JJS6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bco1Q9JJS6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bco1Q9JJS6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bco1Q9JJS6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bco1Q9JJS6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bco1Q9JJS6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bco1Q9JJS6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bco1Q9JJS6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bco1Q9JJS6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bco1Q9JJS6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bco1Q9JJS6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bco1Q9JJS6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bco1Q9JJS6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Bco1Q9JJS6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bco1Q9JJS6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bco1Q9JJS6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Bco1Q9JJS6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Bco1Q9JJS6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bco1Q9JJS6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bco1Q9JJS6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Bco1Q9JJS6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bco1Q9JJS6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bco1Q9JJS6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bco1Q9JJS6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bco1Q9JJS6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bco1Q9JJS6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bco1Q9JJS6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bco1Q9JJS6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bco1Q9JJS6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bco1Q9JJS6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bco1Q9JJS6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bco1Q9JJS6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bco1Q9JJS6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bco1Q9JJS6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bco1Q9JJS6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bco1Q9JJS6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bco1Q9JJS6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bco1Q9JJS6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bco1Q9JJS6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bco1Q9JJS6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bco1Q9JJS6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bco1Q9JJS6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bco1Q9JJS6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bco1Q9JJS6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bco1Q9JJS6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms