Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCL2

GPAM, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAMQ9HCL2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPAMQ9HCL2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPAMQ9HCL2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPAMQ9HCL2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPAMQ9HCL2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GPAMQ9HCL2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPAMQ9HCL2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPAMQ9HCL2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPAMQ9HCL2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPAMQ9HCL2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPAMQ9HCL2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPAMQ9HCL2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPAMQ9HCL2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPAMQ9HCL2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPAMQ9HCL2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPAMQ9HCL2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPAMQ9HCL2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPAMQ9HCL2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPAMQ9HCL2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPAMQ9HCL2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPAMQ9HCL2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPAMQ9HCL2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPAMQ9HCL2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPAMQ9HCL2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GPAMQ9HCL2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPAMQ9HCL2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPAMQ9HCL2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPAMQ9HCL2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPAMQ9HCL2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GPAMQ9HCL2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPAMQ9HCL2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPAMQ9HCL2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPAMQ9HCL2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GPAMQ9HCL2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms