Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOBEC3GQ9HC16 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
APOBEC3GQ9HC16 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3GQ9HC16 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.1 ms