Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLSTN2Q9H4D0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLSTN2Q9H4D0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLSTN2Q9H4D0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLSTN2Q9H4D0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLSTN2Q9H4D0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLSTN2Q9H4D0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLSTN2Q9H4D0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLSTN2Q9H4D0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLSTN2Q9H4D0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLSTN2Q9H4D0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CLSTN2Q9H4D0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLSTN2Q9H4D0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLSTN2Q9H4D0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLSTN2Q9H4D0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLSTN2Q9H4D0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLSTN2Q9H4D0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLSTN2Q9H4D0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLSTN2Q9H4D0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLSTN2Q9H4D0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLSTN2Q9H4D0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLSTN2Q9H4D0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLSTN2Q9H4D0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLSTN2Q9H4D0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLSTN2Q9H4D0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLSTN2Q9H4D0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLSTN2Q9H4D0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLSTN2Q9H4D0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLSTN2Q9H4D0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLSTN2Q9H4D0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLSTN2Q9H4D0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLSTN2Q9H4D0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLSTN2Q9H4D0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLSTN2Q9H4D0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLSTN2Q9H4D0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLSTN2Q9H4D0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLSTN2Q9H4D0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLSTN2Q9H4D0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLSTN2Q9H4D0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLSTN2Q9H4D0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLSTN2Q9H4D0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLSTN2Q9H4D0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLSTN2Q9H4D0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLSTN2Q9H4D0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLSTN2Q9H4D0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLSTN2Q9H4D0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLSTN2Q9H4D0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLSTN2Q9H4D0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLSTN2Q9H4D0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLSTN2Q9H4D0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLSTN2Q9H4D0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLSTN2Q9H4D0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLSTN2Q9H4D0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLSTN2Q9H4D0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLSTN2Q9H4D0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLSTN2Q9H4D0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLSTN2Q9H4D0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLSTN2Q9H4D0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLSTN2Q9H4D0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLSTN2Q9H4D0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CLSTN2Q9H4D0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CLSTN2Q9H4D0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLSTN2Q9H4D0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLSTN2Q9H4D0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLSTN2Q9H4D0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLSTN2Q9H4D0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLSTN2Q9H4D0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLSTN2Q9H4D0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CLSTN2Q9H4D0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLSTN2Q9H4D0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLSTN2Q9H4D0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLSTN2Q9H4D0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CLSTN2Q9H4D0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLSTN2Q9H4D0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLSTN2Q9H4D0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLSTN2Q9H4D0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLSTN2Q9H4D0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLSTN2Q9H4D0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLSTN2Q9H4D0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLSTN2Q9H4D0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLSTN2Q9H4D0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CLSTN2Q9H4D0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLSTN2Q9H4D0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLSTN2Q9H4D0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLSTN2Q9H4D0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CLSTN2Q9H4D0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLSTN2Q9H4D0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLSTN2Q9H4D0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLSTN2Q9H4D0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLSTN2Q9H4D0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLSTN2Q9H4D0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLSTN2Q9H4D0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLSTN2Q9H4D0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLSTN2Q9H4D0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLSTN2Q9H4D0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CLSTN2Q9H4D0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLSTN2Q9H4D0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLSTN2Q9H4D0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLSTN2Q9H4D0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLSTN2Q9H4D0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms