Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snap29Q9ERB0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snap29Q9ERB0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Snap29Q9ERB0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Snap29Q9ERB0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snap29Q9ERB0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snap29Q9ERB0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snap29Q9ERB0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Snap29Q9ERB0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snap29Q9ERB0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snap29Q9ERB0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snap29Q9ERB0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snap29Q9ERB0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snap29Q9ERB0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snap29Q9ERB0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snap29Q9ERB0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snap29Q9ERB0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snap29Q9ERB0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snap29Q9ERB0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snap29Q9ERB0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snap29Q9ERB0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snap29Q9ERB0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snap29Q9ERB0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snap29Q9ERB0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snap29Q9ERB0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snap29Q9ERB0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snap29Q9ERB0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snap29Q9ERB0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snap29Q9ERB0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snap29Q9ERB0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snap29Q9ERB0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snap29Q9ERB0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snap29Q9ERB0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snap29Q9ERB0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snap29Q9ERB0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snap29Q9ERB0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snap29Q9ERB0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snap29Q9ERB0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snap29Q9ERB0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snap29Q9ERB0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snap29Q9ERB0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snap29Q9ERB0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snap29Q9ERB0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snap29Q9ERB0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snap29Q9ERB0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snap29Q9ERB0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Snap29Q9ERB0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snap29Q9ERB0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snap29Q9ERB0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snap29Q9ERB0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snap29Q9ERB0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snap29Q9ERB0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snap29Q9ERB0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Snap29Q9ERB0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snap29Q9ERB0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snap29Q9ERB0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snap29Q9ERB0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snap29Q9ERB0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snap29Q9ERB0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snap29Q9ERB0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.9 ms