Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPB8

Vmn1r54, Vomeronasal type-1 receptor 54, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r54Q9EPB8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r54Q9EPB8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r54Q9EPB8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r54Q9EPB8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r54Q9EPB8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r54Q9EPB8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r54Q9EPB8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r54Q9EPB8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r54Q9EPB8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r54Q9EPB8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r54Q9EPB8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r54Q9EPB8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r54Q9EPB8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r54Q9EPB8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r54Q9EPB8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r54Q9EPB8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Vmn1r54Q9EPB8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn1r54Q9EPB8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r54Q9EPB8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r54Q9EPB8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r54Q9EPB8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r54Q9EPB8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r54Q9EPB8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r54Q9EPB8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r54Q9EPB8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r54Q9EPB8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r54Q9EPB8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r54Q9EPB8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r54Q9EPB8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r54Q9EPB8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r54Q9EPB8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r54Q9EPB8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r54Q9EPB8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r54Q9EPB8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.2 ms