Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT5

Sdf2, Stromal cell-derived factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdf2Q9DCT5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sdf2Q9DCT5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sdf2Q9DCT5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sdf2Q9DCT5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sdf2Q9DCT5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sdf2Q9DCT5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sdf2Q9DCT5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdf2Q9DCT5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdf2Q9DCT5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdf2Q9DCT5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdf2Q9DCT5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdf2Q9DCT5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdf2Q9DCT5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdf2Q9DCT5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdf2Q9DCT5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdf2Q9DCT5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdf2Q9DCT5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdf2Q9DCT5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdf2Q9DCT5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdf2Q9DCT5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdf2Q9DCT5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdf2Q9DCT5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdf2Q9DCT5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdf2Q9DCT5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdf2Q9DCT5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdf2Q9DCT5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdf2Q9DCT5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdf2Q9DCT5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdf2Q9DCT5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms