Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC16

Ergic1, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic1Q9DC16 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ergic1Q9DC16 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ergic1Q9DC16 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ergic1Q9DC16 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ergic1Q9DC16 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ergic1Q9DC16 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ergic1Q9DC16 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ergic1Q9DC16 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ergic1Q9DC16 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ergic1Q9DC16 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ergic1Q9DC16 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ergic1Q9DC16 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ergic1Q9DC16 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ergic1Q9DC16 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ergic1Q9DC16 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ergic1Q9DC16 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ergic1Q9DC16 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ergic1Q9DC16 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ergic1Q9DC16 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ergic1Q9DC16 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ergic1Q9DC16 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ergic1Q9DC16 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ergic1Q9DC16 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ergic1Q9DC16 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ergic1Q9DC16 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ergic1Q9DC16 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ergic1Q9DC16 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ergic1Q9DC16 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ergic1Q9DC16 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ergic1Q9DC16 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ergic1Q9DC16 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ergic1Q9DC16 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ergic1Q9DC16 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ergic1Q9DC16 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ergic1Q9DC16 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ergic1Q9DC16 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ergic1Q9DC16 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ergic1Q9DC16 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ergic1Q9DC16 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ergic1Q9DC16 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ergic1Q9DC16 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ergic1Q9DC16 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ergic1Q9DC16 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ergic1Q9DC16 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ergic1Q9DC16 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ergic1Q9DC16 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ergic1Q9DC16 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ergic1Q9DC16 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ergic1Q9DC16 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ergic1Q9DC16 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ergic1Q9DC16 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ergic1Q9DC16 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ergic1Q9DC16 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ergic1Q9DC16 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ergic1Q9DC16 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ergic1Q9DC16 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ergic1Q9DC16 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ergic1Q9DC16 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ergic1Q9DC16 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ergic1Q9DC16 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ergic1Q9DC16 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ergic1Q9DC16 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ergic1Q9DC16 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms