Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rsph3bQ9DA80 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rsph3bQ9DA80 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rsph3bQ9DA80 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rsph3bQ9DA80 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rsph3bQ9DA80 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rsph3bQ9DA80 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rsph3bQ9DA80 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rsph3bQ9DA80 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rsph3bQ9DA80 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rsph3bQ9DA80 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rsph3bQ9DA80 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rsph3bQ9DA80 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rsph3bQ9DA80 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rsph3bQ9DA80 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rsph3bQ9DA80 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rsph3bQ9DA80 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rsph3bQ9DA80 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rsph3bQ9DA80 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rsph3bQ9DA80 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rsph3bQ9DA80 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsph3bQ9DA80 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsph3bQ9DA80 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsph3bQ9DA80 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsph3bQ9DA80 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsph3bQ9DA80 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsph3bQ9DA80 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsph3bQ9DA80 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph3bQ9DA80 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph3bQ9DA80 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph3bQ9DA80 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph3bQ9DA80 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph3bQ9DA80 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph3bQ9DA80 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph3bQ9DA80 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph3bQ9DA80 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.3 ms