Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SlirpQ9D8T7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SlirpQ9D8T7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms