Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Alkbh4Q9D8F1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Alkbh4Q9D8F1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Alkbh4Q9D8F1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Alkbh4Q9D8F1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Alkbh4Q9D8F1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Alkbh4Q9D8F1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Alkbh4Q9D8F1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Alkbh4Q9D8F1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Alkbh4Q9D8F1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Alkbh4Q9D8F1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Alkbh4Q9D8F1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Alkbh4Q9D8F1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Alkbh4Q9D8F1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Alkbh4Q9D8F1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Alkbh4Q9D8F1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Alkbh4Q9D8F1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Alkbh4Q9D8F1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Alkbh4Q9D8F1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Alkbh4Q9D8F1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Alkbh4Q9D8F1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Alkbh4Q9D8F1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Alkbh4Q9D8F1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Alkbh4Q9D8F1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Alkbh4Q9D8F1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Alkbh4Q9D8F1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Alkbh4Q9D8F1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Alkbh4Q9D8F1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Alkbh4Q9D8F1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Alkbh4Q9D8F1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Alkbh4Q9D8F1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Alkbh4Q9D8F1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Alkbh4Q9D8F1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Alkbh4Q9D8F1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Alkbh4Q9D8F1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Alkbh4Q9D8F1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Alkbh4Q9D8F1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Alkbh4Q9D8F1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alkbh4Q9D8F1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alkbh4Q9D8F1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alkbh4Q9D8F1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alkbh4Q9D8F1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Alkbh4Q9D8F1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alkbh4Q9D8F1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alkbh4Q9D8F1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alkbh4Q9D8F1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alkbh4Q9D8F1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alkbh4Q9D8F1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alkbh4Q9D8F1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Alkbh4Q9D8F1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alkbh4Q9D8F1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alkbh4Q9D8F1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Alkbh4Q9D8F1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alkbh4Q9D8F1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alkbh4Q9D8F1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alkbh4Q9D8F1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alkbh4Q9D8F1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Alkbh4Q9D8F1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Alkbh4Q9D8F1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms