Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpl4Q9D8E6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpl4Q9D8E6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpl4Q9D8E6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpl4Q9D8E6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpl4Q9D8E6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpl4Q9D8E6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpl4Q9D8E6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpl4Q9D8E6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpl4Q9D8E6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpl4Q9D8E6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpl4Q9D8E6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpl4Q9D8E6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpl4Q9D8E6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpl4Q9D8E6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpl4Q9D8E6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpl4Q9D8E6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpl4Q9D8E6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpl4Q9D8E6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpl4Q9D8E6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpl4Q9D8E6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rpl4Q9D8E6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rpl4Q9D8E6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rpl4Q9D8E6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rpl4Q9D8E6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rpl4Q9D8E6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rpl4Q9D8E6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rpl4Q9D8E6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rpl4Q9D8E6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rpl4Q9D8E6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rpl4Q9D8E6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rpl4Q9D8E6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rpl4Q9D8E6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rpl4Q9D8E6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rpl4Q9D8E6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rpl4Q9D8E6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpl4Q9D8E6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpl4Q9D8E6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpl4Q9D8E6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpl4Q9D8E6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpl4Q9D8E6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpl4Q9D8E6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpl4Q9D8E6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpl4Q9D8E6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpl4Q9D8E6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpl4Q9D8E6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpl4Q9D8E6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpl4Q9D8E6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpl4Q9D8E6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpl4Q9D8E6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpl4Q9D8E6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpl4Q9D8E6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpl4Q9D8E6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpl4Q9D8E6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpl4Q9D8E6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpl4Q9D8E6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpl4Q9D8E6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpl4Q9D8E6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpl4Q9D8E6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpl4Q9D8E6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpl4Q9D8E6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpl4Q9D8E6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpl4Q9D8E6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpl4Q9D8E6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpl4Q9D8E6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpl4Q9D8E6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpl4Q9D8E6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpl4Q9D8E6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpl4Q9D8E6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpl4Q9D8E6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpl4Q9D8E6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpl4Q9D8E6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpl4Q9D8E6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpl4Q9D8E6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpl4Q9D8E6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpl4Q9D8E6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rpl4Q9D8E6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rpl4Q9D8E6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpl4Q9D8E6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpl4Q9D8E6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpl4Q9D8E6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpl4Q9D8E6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpl4Q9D8E6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpl4Q9D8E6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpl4Q9D8E6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpl4Q9D8E6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpl4Q9D8E6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpl4Q9D8E6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpl4Q9D8E6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpl4Q9D8E6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpl4Q9D8E6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpl4Q9D8E6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpl4Q9D8E6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpl4Q9D8E6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpl4Q9D8E6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpl4Q9D8E6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpl4Q9D8E6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpl4Q9D8E6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpl4Q9D8E6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpl4Q9D8E6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms