Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pfn4Q9D6I3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pfn4Q9D6I3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pfn4Q9D6I3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pfn4Q9D6I3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pfn4Q9D6I3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pfn4Q9D6I3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pfn4Q9D6I3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pfn4Q9D6I3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pfn4Q9D6I3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pfn4Q9D6I3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pfn4Q9D6I3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pfn4Q9D6I3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pfn4Q9D6I3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pfn4Q9D6I3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pfn4Q9D6I3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pfn4Q9D6I3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pfn4Q9D6I3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pfn4Q9D6I3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.2 ms