Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc105Q9D4K7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc105Q9D4K7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc105Q9D4K7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc105Q9D4K7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc105Q9D4K7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc105Q9D4K7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc105Q9D4K7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc105Q9D4K7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc105Q9D4K7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc105Q9D4K7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc105Q9D4K7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc105Q9D4K7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc105Q9D4K7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc105Q9D4K7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc105Q9D4K7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc105Q9D4K7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc105Q9D4K7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc105Q9D4K7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc105Q9D4K7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc105Q9D4K7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc105Q9D4K7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc105Q9D4K7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc105Q9D4K7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc105Q9D4K7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc105Q9D4K7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc105Q9D4K7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc105Q9D4K7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc105Q9D4K7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc105Q9D4K7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc105Q9D4K7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc105Q9D4K7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc105Q9D4K7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc105Q9D4K7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc105Q9D4K7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc105Q9D4K7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc105Q9D4K7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc105Q9D4K7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc105Q9D4K7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc105Q9D4K7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc105Q9D4K7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc105Q9D4K7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc105Q9D4K7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc105Q9D4K7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc105Q9D4K7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc105Q9D4K7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc105Q9D4K7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc105Q9D4K7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc105Q9D4K7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc105Q9D4K7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc105Q9D4K7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc105Q9D4K7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc105Q9D4K7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc105Q9D4K7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc105Q9D4K7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc105Q9D4K7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc105Q9D4K7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc105Q9D4K7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc105Q9D4K7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc105Q9D4K7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc105Q9D4K7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc105Q9D4K7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc105Q9D4K7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc105Q9D4K7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc105Q9D4K7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc105Q9D4K7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc105Q9D4K7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc105Q9D4K7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc105Q9D4K7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc105Q9D4K7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc105Q9D4K7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc105Q9D4K7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc105Q9D4K7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc105Q9D4K7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc105Q9D4K7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc105Q9D4K7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc105Q9D4K7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc105Q9D4K7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc105Q9D4K7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc105Q9D4K7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc105Q9D4K7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc105Q9D4K7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc105Q9D4K7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc105Q9D4K7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc105Q9D4K7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc105Q9D4K7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc105Q9D4K7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc105Q9D4K7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc105Q9D4K7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc105Q9D4K7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc105Q9D4K7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc105Q9D4K7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc105Q9D4K7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc105Q9D4K7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc105Q9D4K7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc105Q9D4K7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc105Q9D4K7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc105Q9D4K7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc105Q9D4K7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc105Q9D4K7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms