Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Efhd1Q9D4J1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Efhd1Q9D4J1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Efhd1Q9D4J1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Efhd1Q9D4J1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Efhd1Q9D4J1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Efhd1Q9D4J1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Efhd1Q9D4J1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Efhd1Q9D4J1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Efhd1Q9D4J1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Efhd1Q9D4J1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Efhd1Q9D4J1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Efhd1Q9D4J1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Efhd1Q9D4J1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Efhd1Q9D4J1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Efhd1Q9D4J1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Efhd1Q9D4J1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Efhd1Q9D4J1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Efhd1Q9D4J1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Efhd1Q9D4J1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Efhd1Q9D4J1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Efhd1Q9D4J1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Efhd1Q9D4J1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Efhd1Q9D4J1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Efhd1Q9D4J1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Efhd1Q9D4J1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Efhd1Q9D4J1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Efhd1Q9D4J1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Efhd1Q9D4J1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Efhd1Q9D4J1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Efhd1Q9D4J1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Efhd1Q9D4J1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Efhd1Q9D4J1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Efhd1Q9D4J1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Efhd1Q9D4J1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Efhd1Q9D4J1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Efhd1Q9D4J1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Efhd1Q9D4J1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Efhd1Q9D4J1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Efhd1Q9D4J1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Efhd1Q9D4J1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Efhd1Q9D4J1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Efhd1Q9D4J1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Efhd1Q9D4J1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Efhd1Q9D4J1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Efhd1Q9D4J1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Efhd1Q9D4J1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms