Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C6

Lrp2bp, LRP2-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp2bpQ9D4C6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrp2bpQ9D4C6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrp2bpQ9D4C6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrp2bpQ9D4C6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrp2bpQ9D4C6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrp2bpQ9D4C6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrp2bpQ9D4C6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrp2bpQ9D4C6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrp2bpQ9D4C6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrp2bpQ9D4C6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrp2bpQ9D4C6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrp2bpQ9D4C6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrp2bpQ9D4C6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrp2bpQ9D4C6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrp2bpQ9D4C6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrp2bpQ9D4C6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrp2bpQ9D4C6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrp2bpQ9D4C6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrp2bpQ9D4C6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrp2bpQ9D4C6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrp2bpQ9D4C6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrp2bpQ9D4C6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrp2bpQ9D4C6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrp2bpQ9D4C6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrp2bpQ9D4C6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrp2bpQ9D4C6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrp2bpQ9D4C6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrp2bpQ9D4C6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrp2bpQ9D4C6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrp2bpQ9D4C6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrp2bpQ9D4C6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrp2bpQ9D4C6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrp2bpQ9D4C6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrp2bpQ9D4C6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrp2bpQ9D4C6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrp2bpQ9D4C6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrp2bpQ9D4C6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrp2bpQ9D4C6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrp2bpQ9D4C6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrp2bpQ9D4C6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrp2bpQ9D4C6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrp2bpQ9D4C6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrp2bpQ9D4C6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrp2bpQ9D4C6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrp2bpQ9D4C6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrp2bpQ9D4C6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrp2bpQ9D4C6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrp2bpQ9D4C6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrp2bpQ9D4C6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrp2bpQ9D4C6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrp2bpQ9D4C6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrp2bpQ9D4C6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrp2bpQ9D4C6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrp2bpQ9D4C6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrp2bpQ9D4C6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms