Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Spns3Q9D232 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Spns3Q9D232 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Spns3Q9D232 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Spns3Q9D232 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Spns3Q9D232 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Spns3Q9D232 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spns3Q9D232 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spns3Q9D232 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spns3Q9D232 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spns3Q9D232 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Spns3Q9D232 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spns3Q9D232 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spns3Q9D232 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spns3Q9D232 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spns3Q9D232 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spns3Q9D232 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spns3Q9D232 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Spns3Q9D232 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spns3Q9D232 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spns3Q9D232 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Spns3Q9D232 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spns3Q9D232 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spns3Q9D232 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spns3Q9D232 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spns3Q9D232 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spns3Q9D232 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spns3Q9D232 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spns3Q9D232 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spns3Q9D232 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spns3Q9D232 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spns3Q9D232 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Spns3Q9D232 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spns3Q9D232 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spns3Q9D232 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spns3Q9D232 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spns3Q9D232 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spns3Q9D232 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spns3Q9D232 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spns3Q9D232 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spns3Q9D232 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spns3Q9D232 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spns3Q9D232 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Spns3Q9D232 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Spns3Q9D232 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Spns3Q9D232 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Spns3Q9D232 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Spns3Q9D232 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Spns3Q9D232 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Spns3Q9D232 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Spns3Q9D232 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Spns3Q9D232 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Spns3Q9D232 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Spns3Q9D232 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Spns3Q9D232 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Spns3Q9D232 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Spns3Q9D232 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Spns3Q9D232 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Spns3Q9D232 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Spns3Q9D232 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Spns3Q9D232 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Spns3Q9D232 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Spns3Q9D232 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Spns3Q9D232 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Spns3Q9D232 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Spns3Q9D232 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Spns3Q9D232 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Spns3Q9D232 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Spns3Q9D232 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Spns3Q9D232 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Spns3Q9D232 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Spns3Q9D232 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Spns3Q9D232 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Spns3Q9D232 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Spns3Q9D232 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Spns3Q9D232 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Spns3Q9D232 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Spns3Q9D232 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Spns3Q9D232 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Spns3Q9D232 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Spns3Q9D232 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms