Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tspan11Q9D1D1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tspan11Q9D1D1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tspan11Q9D1D1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tspan11Q9D1D1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tspan11Q9D1D1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tspan11Q9D1D1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tspan11Q9D1D1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tspan11Q9D1D1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tspan11Q9D1D1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tspan11Q9D1D1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tspan11Q9D1D1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tspan11Q9D1D1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tspan11Q9D1D1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tspan11Q9D1D1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tspan11Q9D1D1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tspan11Q9D1D1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tspan11Q9D1D1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tspan11Q9D1D1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tspan11Q9D1D1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tspan11Q9D1D1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tspan11Q9D1D1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tspan11Q9D1D1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tspan11Q9D1D1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tspan11Q9D1D1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tspan11Q9D1D1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tspan11Q9D1D1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tspan11Q9D1D1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tspan11Q9D1D1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tspan11Q9D1D1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tspan11Q9D1D1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tspan11Q9D1D1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tspan11Q9D1D1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tspan11Q9D1D1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tspan11Q9D1D1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tspan11Q9D1D1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tspan11Q9D1D1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tspan11Q9D1D1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tspan11Q9D1D1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tspan11Q9D1D1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tspan11Q9D1D1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tspan11Q9D1D1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tspan11Q9D1D1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tspan11Q9D1D1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tspan11Q9D1D1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tspan11Q9D1D1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tspan11Q9D1D1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tspan11Q9D1D1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tspan11Q9D1D1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tspan11Q9D1D1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tspan11Q9D1D1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tspan11Q9D1D1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tspan11Q9D1D1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tspan11Q9D1D1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tspan11Q9D1D1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tspan11Q9D1D1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tspan11Q9D1D1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tspan11Q9D1D1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tspan11Q9D1D1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tspan11Q9D1D1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tspan11Q9D1D1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tspan11Q9D1D1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tspan11Q9D1D1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tspan11Q9D1D1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tspan11Q9D1D1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tspan11Q9D1D1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tspan11Q9D1D1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tspan11Q9D1D1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tspan11Q9D1D1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tspan11Q9D1D1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tspan11Q9D1D1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tspan11Q9D1D1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tspan11Q9D1D1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tspan11Q9D1D1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tspan11Q9D1D1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tspan11Q9D1D1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tspan11Q9D1D1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tspan11Q9D1D1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tspan11Q9D1D1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tspan11Q9D1D1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tspan11Q9D1D1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tspan11Q9D1D1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tspan11Q9D1D1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tspan11Q9D1D1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tspan11Q9D1D1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tspan11Q9D1D1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tspan11Q9D1D1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tspan11Q9D1D1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tspan11Q9D1D1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tspan11Q9D1D1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tspan11Q9D1D1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tspan11Q9D1D1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tspan11Q9D1D1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tspan11Q9D1D1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tspan11Q9D1D1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tspan11Q9D1D1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tspan11Q9D1D1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tspan11Q9D1D1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tspan11Q9D1D1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tspan11Q9D1D1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms