Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYA6

Zcchc8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc8Q9CYA6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zcchc8Q9CYA6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zcchc8Q9CYA6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zcchc8Q9CYA6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zcchc8Q9CYA6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zcchc8Q9CYA6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Zcchc8Q9CYA6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Zcchc8Q9CYA6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Zcchc8Q9CYA6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Zcchc8Q9CYA6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Zcchc8Q9CYA6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Zcchc8Q9CYA6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Zcchc8Q9CYA6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Zcchc8Q9CYA6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Zcchc8Q9CYA6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Zcchc8Q9CYA6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Zcchc8Q9CYA6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Zcchc8Q9CYA6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Zcchc8Q9CYA6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Zcchc8Q9CYA6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Zcchc8Q9CYA6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Zcchc8Q9CYA6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Zcchc8Q9CYA6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zcchc8Q9CYA6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Zcchc8Q9CYA6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zcchc8Q9CYA6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zcchc8Q9CYA6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zcchc8Q9CYA6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zcchc8Q9CYA6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zcchc8Q9CYA6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zcchc8Q9CYA6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Zcchc8Q9CYA6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zcchc8Q9CYA6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zcchc8Q9CYA6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zcchc8Q9CYA6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zcchc8Q9CYA6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zcchc8Q9CYA6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zcchc8Q9CYA6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zcchc8Q9CYA6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Zcchc8Q9CYA6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Zcchc8Q9CYA6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zcchc8Q9CYA6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zcchc8Q9CYA6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zcchc8Q9CYA6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Zcchc8Q9CYA6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zcchc8Q9CYA6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zcchc8Q9CYA6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zcchc8Q9CYA6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zcchc8Q9CYA6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Zcchc8Q9CYA6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zcchc8Q9CYA6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zcchc8Q9CYA6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zcchc8Q9CYA6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zcchc8Q9CYA6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zcchc8Q9CYA6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zcchc8Q9CYA6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zcchc8Q9CYA6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Zcchc8Q9CYA6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zcchc8Q9CYA6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zcchc8Q9CYA6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zcchc8Q9CYA6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zcchc8Q9CYA6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zcchc8Q9CYA6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zcchc8Q9CYA6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zcchc8Q9CYA6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zcchc8Q9CYA6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zcchc8Q9CYA6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zcchc8Q9CYA6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zcchc8Q9CYA6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zcchc8Q9CYA6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zcchc8Q9CYA6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zcchc8Q9CYA6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zcchc8Q9CYA6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zcchc8Q9CYA6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zcchc8Q9CYA6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zcchc8Q9CYA6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zcchc8Q9CYA6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zcchc8Q9CYA6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zcchc8Q9CYA6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zcchc8Q9CYA6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zcchc8Q9CYA6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zcchc8Q9CYA6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Zcchc8Q9CYA6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Zcchc8Q9CYA6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Zcchc8Q9CYA6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Zcchc8Q9CYA6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zcchc8Q9CYA6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Zcchc8Q9CYA6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zcchc8Q9CYA6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zcchc8Q9CYA6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zcchc8Q9CYA6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zcchc8Q9CYA6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Zcchc8Q9CYA6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Zcchc8Q9CYA6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Zcchc8Q9CYA6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zcchc8Q9CYA6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zcchc8Q9CYA6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zcchc8Q9CYA6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zcchc8Q9CYA6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zcchc8Q9CYA6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.3 ms