Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK4

Slc50a1, Sugar transporter SWEET1, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc50a1Q9CXK4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc50a1Q9CXK4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc50a1Q9CXK4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc50a1Q9CXK4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Slc50a1Q9CXK4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc50a1Q9CXK4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc50a1Q9CXK4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc50a1Q9CXK4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc50a1Q9CXK4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc50a1Q9CXK4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc50a1Q9CXK4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc50a1Q9CXK4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc50a1Q9CXK4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc50a1Q9CXK4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc50a1Q9CXK4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc50a1Q9CXK4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc50a1Q9CXK4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc50a1Q9CXK4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc50a1Q9CXK4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc50a1Q9CXK4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc50a1Q9CXK4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc50a1Q9CXK4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc50a1Q9CXK4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc50a1Q9CXK4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc50a1Q9CXK4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc50a1Q9CXK4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc50a1Q9CXK4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc50a1Q9CXK4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc50a1Q9CXK4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc50a1Q9CXK4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc50a1Q9CXK4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc50a1Q9CXK4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 492.4 ms