Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prkrip1Q9CWV6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prkrip1Q9CWV6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Prkrip1Q9CWV6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prkrip1Q9CWV6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prkrip1Q9CWV6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prkrip1Q9CWV6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prkrip1Q9CWV6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prkrip1Q9CWV6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prkrip1Q9CWV6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prkrip1Q9CWV6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prkrip1Q9CWV6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Prkrip1Q9CWV6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Prkrip1Q9CWV6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prkrip1Q9CWV6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prkrip1Q9CWV6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prkrip1Q9CWV6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prkrip1Q9CWV6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prkrip1Q9CWV6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prkrip1Q9CWV6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Prkrip1Q9CWV6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prkrip1Q9CWV6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prkrip1Q9CWV6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prkrip1Q9CWV6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prkrip1Q9CWV6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prkrip1Q9CWV6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Prkrip1Q9CWV6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prkrip1Q9CWV6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prkrip1Q9CWV6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prkrip1Q9CWV6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prkrip1Q9CWV6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prkrip1Q9CWV6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prkrip1Q9CWV6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prkrip1Q9CWV6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prkrip1Q9CWV6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prkrip1Q9CWV6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prkrip1Q9CWV6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prkrip1Q9CWV6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prkrip1Q9CWV6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prkrip1Q9CWV6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prkrip1Q9CWV6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prkrip1Q9CWV6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prkrip1Q9CWV6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Prkrip1Q9CWV6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prkrip1Q9CWV6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prkrip1Q9CWV6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prkrip1Q9CWV6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prkrip1Q9CWV6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prkrip1Q9CWV6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prkrip1Q9CWV6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prkrip1Q9CWV6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prkrip1Q9CWV6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prkrip1Q9CWV6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Prkrip1Q9CWV6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Prkrip1Q9CWV6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prkrip1Q9CWV6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prkrip1Q9CWV6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prkrip1Q9CWV6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Prkrip1Q9CWV6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prkrip1Q9CWV6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prkrip1Q9CWV6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prkrip1Q9CWV6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prkrip1Q9CWV6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prkrip1Q9CWV6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prkrip1Q9CWV6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prkrip1Q9CWV6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prkrip1Q9CWV6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prkrip1Q9CWV6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prkrip1Q9CWV6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prkrip1Q9CWV6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prkrip1Q9CWV6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prkrip1Q9CWV6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prkrip1Q9CWV6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prkrip1Q9CWV6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prkrip1Q9CWV6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prkrip1Q9CWV6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prkrip1Q9CWV6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prkrip1Q9CWV6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prkrip1Q9CWV6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prkrip1Q9CWV6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prkrip1Q9CWV6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prkrip1Q9CWV6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prkrip1Q9CWV6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prkrip1Q9CWV6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prkrip1Q9CWV6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prkrip1Q9CWV6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prkrip1Q9CWV6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prkrip1Q9CWV6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prkrip1Q9CWV6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prkrip1Q9CWV6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prkrip1Q9CWV6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prkrip1Q9CWV6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prkrip1Q9CWV6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prkrip1Q9CWV6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prkrip1Q9CWV6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Prkrip1Q9CWV6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prkrip1Q9CWV6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prkrip1Q9CWV6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prkrip1Q9CWV6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prkrip1Q9CWV6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms