Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR29

Ccdc43, Coiled-coil domain-containing protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc43Q9CR29 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc43Q9CR29 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc43Q9CR29 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc43Q9CR29 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc43Q9CR29 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc43Q9CR29 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc43Q9CR29 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc43Q9CR29 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc43Q9CR29 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc43Q9CR29 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc43Q9CR29 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc43Q9CR29 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc43Q9CR29 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc43Q9CR29 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc43Q9CR29 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc43Q9CR29 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc43Q9CR29 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc43Q9CR29 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc43Q9CR29 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc43Q9CR29 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc43Q9CR29 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc43Q9CR29 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc43Q9CR29 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc43Q9CR29 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc43Q9CR29 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc43Q9CR29 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc43Q9CR29 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc43Q9CR29 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc43Q9CR29 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc43Q9CR29 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc43Q9CR29 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc43Q9CR29 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc43Q9CR29 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc43Q9CR29 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc43Q9CR29 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc43Q9CR29 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc43Q9CR29 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc43Q9CR29 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc43Q9CR29 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc43Q9CR29 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc43Q9CR29 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc43Q9CR29 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc43Q9CR29 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc43Q9CR29 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc43Q9CR29 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc43Q9CR29 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc43Q9CR29 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc43Q9CR29 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc43Q9CR29 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc43Q9CR29 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc43Q9CR29 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc43Q9CR29 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc43Q9CR29 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc43Q9CR29 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc43Q9CR29 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc43Q9CR29 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc43Q9CR29 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc43Q9CR29 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc43Q9CR29 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc43Q9CR29 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc43Q9CR29 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc43Q9CR29 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc43Q9CR29 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc43Q9CR29 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc43Q9CR29 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc43Q9CR29 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc43Q9CR29 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc43Q9CR29 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc43Q9CR29 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc43Q9CR29 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc43Q9CR29 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc43Q9CR29 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc43Q9CR29 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc43Q9CR29 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc43Q9CR29 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc43Q9CR29 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc43Q9CR29 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc43Q9CR29 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc43Q9CR29 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc43Q9CR29 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc43Q9CR29 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc43Q9CR29 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc43Q9CR29 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc43Q9CR29 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc43Q9CR29 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc43Q9CR29 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc43Q9CR29 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc43Q9CR29 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc43Q9CR29 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc43Q9CR29 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc43Q9CR29 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc43Q9CR29 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc43Q9CR29 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc43Q9CR29 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc43Q9CR29 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc43Q9CR29 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc43Q9CR29 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccdc43Q9CR29 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc43Q9CR29 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc43Q9CR29 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms