Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE0

Rnf138, E3 ubiquitin-protein ligase RNF138, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138Q9CQE0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf138Q9CQE0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf138Q9CQE0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf138Q9CQE0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf138Q9CQE0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf138Q9CQE0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf138Q9CQE0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf138Q9CQE0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf138Q9CQE0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf138Q9CQE0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf138Q9CQE0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf138Q9CQE0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf138Q9CQE0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf138Q9CQE0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf138Q9CQE0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf138Q9CQE0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf138Q9CQE0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf138Q9CQE0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf138Q9CQE0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf138Q9CQE0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf138Q9CQE0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf138Q9CQE0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf138Q9CQE0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf138Q9CQE0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf138Q9CQE0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf138Q9CQE0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf138Q9CQE0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf138Q9CQE0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf138Q9CQE0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf138Q9CQE0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf138Q9CQE0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf138Q9CQE0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf138Q9CQE0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf138Q9CQE0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf138Q9CQE0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf138Q9CQE0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf138Q9CQE0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf138Q9CQE0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf138Q9CQE0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf138Q9CQE0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf138Q9CQE0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rnf138Q9CQE0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rnf138Q9CQE0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rnf138Q9CQE0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rnf138Q9CQE0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rnf138Q9CQE0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rnf138Q9CQE0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf138Q9CQE0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf138Q9CQE0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf138Q9CQE0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf138Q9CQE0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf138Q9CQE0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf138Q9CQE0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf138Q9CQE0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf138Q9CQE0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf138Q9CQE0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf138Q9CQE0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf138Q9CQE0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf138Q9CQE0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf138Q9CQE0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf138Q9CQE0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf138Q9CQE0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf138Q9CQE0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf138Q9CQE0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf138Q9CQE0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf138Q9CQE0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf138Q9CQE0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf138Q9CQE0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf138Q9CQE0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf138Q9CQE0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf138Q9CQE0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf138Q9CQE0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf138Q9CQE0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf138Q9CQE0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf138Q9CQE0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf138Q9CQE0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf138Q9CQE0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf138Q9CQE0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf138Q9CQE0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf138Q9CQE0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf138Q9CQE0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf138Q9CQE0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf138Q9CQE0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf138Q9CQE0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf138Q9CQE0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf138Q9CQE0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf138Q9CQE0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf138Q9CQE0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf138Q9CQE0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf138Q9CQE0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf138Q9CQE0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf138Q9CQE0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf138Q9CQE0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf138Q9CQE0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf138Q9CQE0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf138Q9CQE0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf138Q9CQE0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf138Q9CQE0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf138Q9CQE0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rnf138Q9CQE0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.5 ms