Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6v0e1Q9CQD8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6v0e1Q9CQD8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6v0e1Q9CQD8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6v0e1Q9CQD8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6v0e1Q9CQD8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6v0e1Q9CQD8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6v0e1Q9CQD8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6v0e1Q9CQD8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp6v0e1Q9CQD8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp6v0e1Q9CQD8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp6v0e1Q9CQD8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp6v0e1Q9CQD8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp6v0e1Q9CQD8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp6v0e1Q9CQD8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Atp6v0e1Q9CQD8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Atp6v0e1Q9CQD8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Atp6v0e1Q9CQD8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Atp6v0e1Q9CQD8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Atp6v0e1Q9CQD8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Atp6v0e1Q9CQD8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Atp6v0e1Q9CQD8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp6v0e1Q9CQD8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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