Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSDMCQ9BYG8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms