Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXR3

ERVK-6, Endogenous retrovirus group K member 6 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-6Q9BXR3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVK-6Q9BXR3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVK-6Q9BXR3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVK-6Q9BXR3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVK-6Q9BXR3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVK-6Q9BXR3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVK-6Q9BXR3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK-6Q9BXR3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK-6Q9BXR3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK-6Q9BXR3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK-6Q9BXR3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK-6Q9BXR3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK-6Q9BXR3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK-6Q9BXR3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK-6Q9BXR3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK-6Q9BXR3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK-6Q9BXR3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK-6Q9BXR3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERVK-6Q9BXR3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVK-6Q9BXR3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVK-6Q9BXR3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVK-6Q9BXR3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVK-6Q9BXR3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVK-6Q9BXR3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVK-6Q9BXR3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVK-6Q9BXR3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVK-6Q9BXR3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERVK-6Q9BXR3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERVK-6Q9BXR3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERVK-6Q9BXR3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVK-6Q9BXR3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVK-6Q9BXR3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVK-6Q9BXR3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVK-6Q9BXR3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERVK-6Q9BXR3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-6Q9BXR3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-6Q9BXR3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-6Q9BXR3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-6Q9BXR3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-6Q9BXR3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-6Q9BXR3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-6Q9BXR3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-6Q9BXR3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-6Q9BXR3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-6Q9BXR3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-6Q9BXR3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERVK-6Q9BXR3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVK-6Q9BXR3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVK-6Q9BXR3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVK-6Q9BXR3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVK-6Q9BXR3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVK-6Q9BXR3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVK-6Q9BXR3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVK-6Q9BXR3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVK-6Q9BXR3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERVK-6Q9BXR3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVK-6Q9BXR3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVK-6Q9BXR3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVK-6Q9BXR3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVK-6Q9BXR3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVK-6Q9BXR3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVK-6Q9BXR3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVK-6Q9BXR3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVK-6Q9BXR3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVK-6Q9BXR3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVK-6Q9BXR3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVK-6Q9BXR3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVK-6Q9BXR3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVK-6Q9BXR3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVK-6Q9BXR3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVK-6Q9BXR3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVK-6Q9BXR3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVK-6Q9BXR3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVK-6Q9BXR3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVK-6Q9BXR3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVK-6Q9BXR3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVK-6Q9BXR3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVK-6Q9BXR3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVK-6Q9BXR3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVK-6Q9BXR3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVK-6Q9BXR3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVK-6Q9BXR3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVK-6Q9BXR3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVK-6Q9BXR3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ERVK-6Q9BXR3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ERVK-6Q9BXR3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ERVK-6Q9BXR3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVK-6Q9BXR3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVK-6Q9BXR3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVK-6Q9BXR3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVK-6Q9BXR3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVK-6Q9BXR3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVK-6Q9BXR3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVK-6Q9BXR3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVK-6Q9BXR3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVK-6Q9BXR3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVK-6Q9BXR3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVK-6Q9BXR3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVK-6Q9BXR3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVK-6Q9BXR3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms