Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GpnmbQ99P91 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GpnmbQ99P91 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GpnmbQ99P91 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GpnmbQ99P91 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GpnmbQ99P91 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GpnmbQ99P91 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GpnmbQ99P91 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GpnmbQ99P91 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GpnmbQ99P91 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GpnmbQ99P91 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GpnmbQ99P91 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GpnmbQ99P91 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GpnmbQ99P91 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GpnmbQ99P91 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GpnmbQ99P91 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GpnmbQ99P91 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GpnmbQ99P91 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GpnmbQ99P91 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GpnmbQ99P91 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GpnmbQ99P91 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GpnmbQ99P91 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GpnmbQ99P91 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GpnmbQ99P91 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
GpnmbQ99P91 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GpnmbQ99P91 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GpnmbQ99P91 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GpnmbQ99P91 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GpnmbQ99P91 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GpnmbQ99P91 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GpnmbQ99P91 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GpnmbQ99P91 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GpnmbQ99P91 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GpnmbQ99P91 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GpnmbQ99P91 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GpnmbQ99P91 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GpnmbQ99P91 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GpnmbQ99P91 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GpnmbQ99P91 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GpnmbQ99P91 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GpnmbQ99P91 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GpnmbQ99P91 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GpnmbQ99P91 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GpnmbQ99P91 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GpnmbQ99P91 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GpnmbQ99P91 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GpnmbQ99P91 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GpnmbQ99P91 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GpnmbQ99P91 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GpnmbQ99P91 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GpnmbQ99P91 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GpnmbQ99P91 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GpnmbQ99P91 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GpnmbQ99P91 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GpnmbQ99P91 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GpnmbQ99P91 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GpnmbQ99P91 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GpnmbQ99P91 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GpnmbQ99P91 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GpnmbQ99P91 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GpnmbQ99P91 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GpnmbQ99P91 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GpnmbQ99P91 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GpnmbQ99P91 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GpnmbQ99P91 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GpnmbQ99P91 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GpnmbQ99P91 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GpnmbQ99P91 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GpnmbQ99P91 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GpnmbQ99P91 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GpnmbQ99P91 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GpnmbQ99P91 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GpnmbQ99P91 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GpnmbQ99P91 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GpnmbQ99P91 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GpnmbQ99P91 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GpnmbQ99P91 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GpnmbQ99P91 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GpnmbQ99P91 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GpnmbQ99P91 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GpnmbQ99P91 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
GpnmbQ99P91 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GpnmbQ99P91 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GpnmbQ99P91 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms