Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gps1Q99LD4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gps1Q99LD4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gps1Q99LD4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gps1Q99LD4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gps1Q99LD4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gps1Q99LD4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gps1Q99LD4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gps1Q99LD4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gps1Q99LD4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gps1Q99LD4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gps1Q99LD4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gps1Q99LD4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gps1Q99LD4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gps1Q99LD4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gps1Q99LD4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gps1Q99LD4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gps1Q99LD4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gps1Q99LD4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gps1Q99LD4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gps1Q99LD4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gps1Q99LD4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gps1Q99LD4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gps1Q99LD4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gps1Q99LD4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gps1Q99LD4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gps1Q99LD4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gps1Q99LD4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gps1Q99LD4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gps1Q99LD4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gps1Q99LD4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gps1Q99LD4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gps1Q99LD4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gps1Q99LD4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gps1Q99LD4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gps1Q99LD4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gps1Q99LD4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gps1Q99LD4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gps1Q99LD4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gps1Q99LD4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gps1Q99LD4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gps1Q99LD4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gps1Q99LD4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gps1Q99LD4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gps1Q99LD4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gps1Q99LD4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gps1Q99LD4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gps1Q99LD4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gps1Q99LD4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gps1Q99LD4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gps1Q99LD4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gps1Q99LD4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gps1Q99LD4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gps1Q99LD4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gps1Q99LD4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gps1Q99LD4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gps1Q99LD4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gps1Q99LD4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gps1Q99LD4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gps1Q99LD4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gps1Q99LD4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gps1Q99LD4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gps1Q99LD4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gps1Q99LD4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gps1Q99LD4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gps1Q99LD4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gps1Q99LD4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gps1Q99LD4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gps1Q99LD4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gps1Q99LD4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gps1Q99LD4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gps1Q99LD4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gps1Q99LD4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gps1Q99LD4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gps1Q99LD4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gps1Q99LD4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gps1Q99LD4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gps1Q99LD4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gps1Q99LD4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gps1Q99LD4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gps1Q99LD4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gps1Q99LD4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gps1Q99LD4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gps1Q99LD4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gps1Q99LD4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gps1Q99LD4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gps1Q99LD4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gps1Q99LD4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gps1Q99LD4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gps1Q99LD4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gps1Q99LD4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gps1Q99LD4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gps1Q99LD4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gps1Q99LD4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gps1Q99LD4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gps1Q99LD4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gps1Q99LD4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gps1Q99LD4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gps1Q99LD4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gps1Q99LD4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms