Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ciao1Q99KN2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ciao1Q99KN2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ciao1Q99KN2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ciao1Q99KN2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ciao1Q99KN2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ciao1Q99KN2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ciao1Q99KN2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ciao1Q99KN2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ciao1Q99KN2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ciao1Q99KN2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ciao1Q99KN2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ciao1Q99KN2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ciao1Q99KN2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ciao1Q99KN2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ciao1Q99KN2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ciao1Q99KN2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ciao1Q99KN2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ciao1Q99KN2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ciao1Q99KN2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ciao1Q99KN2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ciao1Q99KN2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ciao1Q99KN2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ciao1Q99KN2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ciao1Q99KN2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ciao1Q99KN2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ciao1Q99KN2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ciao1Q99KN2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ciao1Q99KN2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ciao1Q99KN2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ciao1Q99KN2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ciao1Q99KN2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ciao1Q99KN2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ciao1Q99KN2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ciao1Q99KN2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ciao1Q99KN2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ciao1Q99KN2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ciao1Q99KN2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ciao1Q99KN2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ciao1Q99KN2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ciao1Q99KN2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ciao1Q99KN2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ciao1Q99KN2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ciao1Q99KN2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ciao1Q99KN2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ciao1Q99KN2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ciao1Q99KN2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ciao1Q99KN2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ciao1Q99KN2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ciao1Q99KN2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ciao1Q99KN2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ciao1Q99KN2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ciao1Q99KN2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ciao1Q99KN2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ciao1Q99KN2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ciao1Q99KN2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ciao1Q99KN2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ciao1Q99KN2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ciao1Q99KN2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ciao1Q99KN2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ciao1Q99KN2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ciao1Q99KN2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ciao1Q99KN2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ciao1Q99KN2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ciao1Q99KN2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ciao1Q99KN2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ciao1Q99KN2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ciao1Q99KN2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ciao1Q99KN2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ciao1Q99KN2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ciao1Q99KN2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ciao1Q99KN2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ciao1Q99KN2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ciao1Q99KN2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ciao1Q99KN2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ciao1Q99KN2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ciao1Q99KN2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ciao1Q99KN2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ciao1Q99KN2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ciao1Q99KN2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ciao1Q99KN2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ciao1Q99KN2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ciao1Q99KN2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ciao1Q99KN2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ciao1Q99KN2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ciao1Q99KN2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ciao1Q99KN2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ciao1Q99KN2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ciao1Q99KN2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ciao1Q99KN2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ciao1Q99KN2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ciao1Q99KN2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ciao1Q99KN2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ciao1Q99KN2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ciao1Q99KN2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ciao1Q99KN2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ciao1Q99KN2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ciao1Q99KN2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ciao1Q99KN2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ciao1Q99KN2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms